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Mejor software de facturación 2026 (autónomos y pymes)

Siete programas comparados con honestidad: precios reales, compatibilidad con Verifactu, pros y contras, y cuál elegir según tu perfil como autónomo o pyme española.

Elegir un software de facturación no es solo una cuestión de precio. Desde 2026, la Ley Antifraude y el sistema Verifactu obligan a que los programas homologados cumplan requisitos técnicos estrictos. Si cambias de software más adelante, puede suponer migrar datos, rehacer plantillas y volver a aprender una herramienta. Mejor elegir bien desde el principio.

En esta guía hemos analizado los siete programas más usados por autónomos y pymes en España: Holded, Quipu, Contasimple, Billin, FacturaDirecta, Sage y FactuSol. Para cada uno explicamos para qué perfil encaja, cuánto cuesta de verdad y cuáles son sus puntos débiles. Si ya tienes claro que quieres comparar dos opciones concretas, consulta nuestras comparativa Holded vs Quipu o la comparativa Quipu vs Billin.

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Criterios para elegir un software de facturación

Antes de entrar en los programas concretos, estos son los factores que más importan a un autónomo o pyme española en 2026:

  • Precio real. Muchos planes de entrada no incluyen la gestión de gastos, los modelos de impuestos o la contabilidad. Compara el plan que realmente necesitarás, no el de prueba.
  • Facilidad de uso. Si el programa requiere conocimientos contables para emitir una factura, no es el adecuado para la mayoría de autónomos.
  • Compatibilidad con Verifactu y la Ley Antifraude 2026. Todos los software deben adaptarse a la normativa de registro de facturación. Comprueba que el tuyo está homologado o en proceso de serlo.
  • Gestión de gastos e impuestos. Lo ideal es que el mismo programa te ayude a preparar los modelos 303 (IVA) y 130 (IRPF trimestral) o que los exporte de forma automática.
  • Integraciones. Con tu banco (para conciliación automática), tu gestoría, tu tienda online o tu CRM.

Tabla comparativa: los 7 mejores programas de facturación

Software Mejor para Plan gratuito Precio de entrada Verifactu
Holded Pymes que quieren ERP completo No (prueba 14 días) ~14 €/mes Sí
Quipu Autónomos y freelances No (prueba 15 días) ~9 €/mes Sí
Contasimple Autónomos con pocas facturas Sí (3 facturas/mes) ~9,90 €/mes En proceso
Billin Autónomos que priorizan sencillez Sí (básico) ~9 €/mes En proceso
FacturaDirecta Pymes con facturación recurrente No (prueba 30 días) ~19 €/mes Sí
Sage Pymes con contabilidad compleja No ~15 €/mes Sí
FactuSol Empresas con facturación en escritorio Sí (versión gratuita) Gratuito / ~120 €/año En proceso
Sobre Verifactu y la Ley Antifraude: La normativa exige que los sistemas informáticos de facturación garanticen la integridad, conservación, accesibilidad, legibilidad, trazabilidad e inalterabilidad de los registros. La entrada en vigor definitiva para empresas y autónomos se está produciendo de forma progresiva durante 2025-2026. Comprueba siempre el estado de homologación en la web de cada proveedor antes de contratar.

1. Holded — ERP + facturación todo en uno

Para quién es

Holded es la opción más completa del mercado español. No es solo un programa de facturas: integra contabilidad, inventario, proyectos, CRM y tesorería bajo una misma plataforma. Tiene sentido para pymes que quieren centralizar toda su gestión y evitar varios programas distintos. Para un autónomo con pocas facturas al mes, puede ser excesivo.

Pros

  • Facturación, contabilidad, inventario, proyectos y CRM integrados de forma nativa.
  • Desarrollado en España: pensado para el marco fiscal español (SII, modelos de IVA, IBI, etc.).
  • Conciliación bancaria automática con los principales bancos españoles.
  • Interfaz moderna y bien diseñada, con app móvil funcional.
  • Compatible con Verifactu.

Contras

  • Precio por empresa, no por usuario: los planes avanzados escalan rápido (de 14 € a más de 60 €/mes).
  • Curva de aprendizaje media para configurar todos los módulos correctamente.
  • Para un autónomo que solo necesita emitir facturas, resulta sobredimensionado.

Precio orientativo: Plan Básico desde ~14 €/mes. Plan Estándar ~36 €/mes. Plan Avanzado ~64 €/mes. Precios facturados anualmente.

2. Quipu — el favorito de los freelances españoles

Para quién es

Quipu está diseñado específicamente para autónomos y pequeñas empresas españolas que quieren facturar, controlar gastos y preparar sus impuestos trimestrales sin necesitar conocimientos contables. Es el software más orientado al perfil del autónomo medio: intuitivo, rápido de configurar y con soporte en español. Consulta nuestra comparativa Holded vs Quipu si dudas entre ambos.

Pros

  • Preparación automática de los modelos 303, 130 y 115 lista para enviar a Hacienda o a tu gestoría.
  • Digitalización de tickets y facturas de gasto con la app móvil (OCR).
  • Conciliación bancaria incluida desde planes intermedios.
  • Interfaz muy sencilla, pensada para personas sin formación contable.
  • Compatible con Verifactu.

Contras

  • Sin plan gratuito; solo 15 días de prueba.
  • Las funciones de inventario y almacén son limitadas comparadas con Holded o Sage.
  • No es la mejor opción si la empresa factura más de 500.000 € al año y necesita contabilidad analítica completa.

Precio orientativo: Plan Autónomo desde ~9 €/mes. Plan Pyme desde ~19 €/mes. Plan Empresa desde ~39 €/mes.

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3. Contasimple — para autónomos con pocas facturas

Para quién es

Contasimple es la opción más accesible para autónomos que facturan poco y quieren una solución gratuita o muy económica para empezar. Su plan gratuito, aunque limitado a 3 facturas al mes, es suficiente para muchos trabajadores por cuenta propia con poca actividad. A medida que crece la facturación, sus planes de pago son competitivos.

Pros

  • Plan gratuito real: hasta 3 facturas y 3 facturas de gasto al mes sin coste.
  • Diseño de plantillas de factura personalizable sin conocimientos técnicos.
  • Exportación de libros de IVA y registro de facturas para la gestoría.
  • Disponible en español, catalán, euskera y gallego.

Contras

  • El plan gratuito es muy restrictivo: 3 facturas al mes se quedan cortas enseguida.
  • La conciliación bancaria y los modelos de impuestos solo están en planes superiores.
  • La adaptación a Verifactu está en proceso; comprueba el estado actual.

Precio orientativo: Plan Gratuito (3 facturas/mes). Plan Básico ~9,90 €/mes. Plan Profesional ~19,90 €/mes.

4. Billin — sencillez ante todo

Para quién es

Billin es el programa de facturación más simple de esta lista. Si lo que necesitas es emitir facturas profesionales rápidamente, sin curva de aprendizaje y con un plan gratuito para empezar, Billin es una opción sólida. No intenta ser un ERP ni una herramienta contable compleja: hace las facturas bien y de forma inmediata. Compáralo con Quipu en nuestra comparativa Quipu vs Billin.

Pros

  • Plan gratuito con facturas ilimitadas y funciones básicas.
  • Interfaz muy limpia y rápida de aprender: puedes emitir tu primera factura en menos de 5 minutos.
  • Presupuestos, albaranes y facturas recurrentes incluidos incluso en planes bajos.
  • App móvil bien valorada.

Contras

  • Las funciones contables y de impuestos son escasas en los planes básicos.
  • Sin conciliación bancaria en el plan gratuito.
  • La adaptación a Verifactu está en proceso de implementación.

Precio orientativo: Plan Gratuito (básico). Plan Profesional ~9 €/mes. Plan Business ~18 €/mes.

5. FacturaDirecta — para pymes con facturación recurrente

Para quién es

FacturaDirecta destaca en entornos donde se necesita facturación recurrente (suscripciones, contratos periódicos) y un control detallado de cobros pendientes. Es una opción madura y estable, muy utilizada por agencias, consultoras y despachos profesionales que facturan a los mismos clientes cada mes.

Pros

  • Facturación recurrente muy bien implementada: crea la factura una vez y se envía sola cada mes.
  • Portal del cliente para que tus compradores descarguen sus facturas directamente.
  • Control de cobros y pagos pendientes con recordatorios automáticos.
  • Compatible con Verifactu.
  • Prueba gratuita de 30 días sin tarjeta.

Contras

  • El precio de entrada (~19 €/mes) es más alto que Quipu o Billin para funciones similares.
  • La interfaz es funcional pero menos moderna que Holded o Billin.
  • Las funciones de contabilidad completa son limitadas comparadas con Sage o Holded.

Precio orientativo: Plan Básico ~19 €/mes. Plan Profesional ~35 €/mes. Plan Empresas ~59 €/mes.

6. Sage — para pymes con contabilidad seria

Para quién es

Sage es uno de los nombres de referencia en software de gestión empresarial en España. Su solución para pymes (Sage 50 y Sage Business Cloud) cubre desde la facturación básica hasta la contabilidad analítica, la gestión de personal y los informes financieros. Es la opción que suelen recomendar las gestorías para empresas con contabilidad compleja o con obligaciones mercantiles.

Pros

  • Contabilidad completa: plan de cuentas, asientos, balance, cuenta de resultados.
  • Compatible con los principales formatos que exigen Hacienda y los registros mercantiles.
  • Compatible con Verifactu en sus versiones actualizadas.
  • Gran red de soporte y gestores certificados en España.

Contras

  • Interfaz más tradicional y menos intuitiva que alternativas más modernas.
  • La versión de escritorio (Sage 50) requiere instalación y actualizaciones manuales.
  • Para un autónomo sin conocimientos contables, resulta complejo de manejar sin ayuda.

Precio orientativo: Sage Business Cloud desde ~15 €/mes. Sage 50 desde ~40 €/mes (versión escritorio). Hay licencias anuales con diferentes módulos.

7. FactuSol — la opción gratuita de escritorio

Para quién es

FactuSol es un programa de facturación de escritorio para Windows que ofrece una versión gratuita genuinamente funcional. Lo usa sobre todo el comercio tradicional, pequeños negocios y empresas que prefieren trabajar en local en lugar de en la nube. Si no quieres pagar una suscripción mensual y tu facturación no es muy compleja, es una opción a considerar.

Pros

  • Versión gratuita con funciones de facturación reales, sin límite de facturas.
  • Control de almacén, presupuestos, pedidos y albaranes incluidos en la versión gratuita.
  • Sin dependencia de internet: funciona offline.
  • Versión de pago (~120 €/año) añade actualizaciones y soporte prioritario.

Contras

  • Solo disponible para Windows: no hay versión web ni app móvil oficial.
  • La adaptación a Verifactu está en proceso; el trabajo en local complica la homologación.
  • Sin conciliación bancaria ni integración con bancos.
  • El diseño es funcional pero poco moderno.

Precio orientativo: Versión gratuita disponible. Versión premium ~120 €/año (actualizaciones + soporte).

Verifactu y la Ley Antifraude: qué debes saber en 2026

La Ley 11/2021 de Medidas de Prevención y Lucha contra el Fraude Fiscal obliga a los sistemas informáticos de facturación a cumplir una serie de requisitos técnicos diseñados para evitar la manipulación de registros. El reglamento de desarrollo (Reglamento Verifactu) establece que cada factura emitida quede registrada con un código seguro de verificación y, opcionalmente, sea enviada en tiempo real a la Agencia Tributaria.

La implantación está siendo progresiva: las grandes empresas ya deben cumplir desde finales de 2025, y los autónomos y pymes tienen plazos que se van concretando a lo largo de 2026. La consecuencia práctica es clara: si tu software de facturación no está adaptado o en proceso de adaptación, deberías cambiar cuanto antes. De los programas de esta comparativa, Holded, Quipu, FacturaDirecta y Sage ya cuentan con planes de compatibilidad avanzados.

¿Cuál elegir según tu perfil?

No hay un mejor software de facturación universal. Depende de tu situación:

  • Autónomo con pocas facturas al mes: Empieza con el plan gratuito de Billin o Contasimple. Si también quieres preparar tus impuestos trimestrales sin gestoría, da el salto a Quipu.
  • Autónomo con actividad media o alta: Quipu es la opción más equilibrada: precio razonable, gestión de impuestos integrada y compatible con Verifactu.
  • Pyme con facturación recurrente a clientes fijos: FacturaDirecta resuelve muy bien el cobro periódico y el portal de cliente.
  • Pyme que quiere centralizar toda la gestión: Holded si quieres ERP completo en la nube; Sage si tu gestoría trabaja con él o necesitas contabilidad analítica.
  • Negocio tradicional sin internet estable: FactuSol en versión gratuita de escritorio cubre las necesidades básicas sin coste.
  • Autónomo que necesita solo un generador de facturas puntual: Usa nuestra herramienta gratuita de facturas sin registrarte.

Si quieres profundizar en la comparativa entre los dos líderes del mercado para autónomos, consulta también nuestra guía sobre el mejor programa de facturación para autónomos con más detalle sobre el perfil freelance.

Preguntas frecuentes sobre software de facturación

¿Qué es Verifactu y qué software lo cumple?

Verifactu es el sistema de remisión voluntaria de registros de facturación a la Agencia Tributaria, enmarcado en la Ley Antifraude 11/2021. A partir de 2025-2026 los software deben estar homologados. Holded, Quipu, FacturaDirecta y Sage ya tienen planes de compatibilidad avanzados. Comprueba siempre el estado actual en la web del proveedor.

¿Cuánto cuesta un software de facturación para autónomos?

El rango va de 0 € (planes gratuitos de Contasimple o Billin) hasta más de 60 €/mes en soluciones como Holded con todos los módulos. Para un autónomo con actividad media, entre 9 y 20 €/mes es suficiente. Para una pyme con contabilidad, entre 30 y 60 €/mes.

¿Puede un autónomo hacer facturas gratis?

Sí. Contasimple ofrece un plan gratuito con hasta 3 facturas al mes. Billin tiene un plan básico gratuito con facturas ilimitadas. Para necesidades puntuales, también puedes usar el generador de facturas gratuito de NegociosyPymes.es sin registrarte.

¿Qué diferencia hay entre un programa de facturación y un ERP?

Un programa de facturación cubre la emisión de facturas, control de gastos y, en algunos casos, los modelos de impuestos. Un ERP (como Holded o Sage) integra además contabilidad completa, inventario, compras, proyectos y CRM. Para un autónomo, un software de facturación suele ser suficiente; una pyme con más procesos puede necesitar un ERP.

¿Holded o Quipu: cuál es mejor para autónomos?

Para la mayoría de autónomos, Quipu es más adecuado: más sencillo, más económico y pensado específicamente para el freelance o profesional independiente. Holded tiene más sentido cuando la empresa crece y necesita módulos adicionales como inventario o proyectos. Consulta la comparativa detallada Holded vs Quipu.

Aviso sobre precios: Los precios indicados son orientativos a junio de 2026, basados en los planes de facturación anual. El pago mensual suele tener un recargo del 15-25%. Los proveedores actualizan sus tarifas con frecuencia: comprueba siempre el precio actual en su web antes de contratar.